各部事工概要
傳道部主力推動福音事工，積極推動教會合一見證，曾多次號召全港教會舉辦聯合佈道工作，如葛培理佈道大會、包樂佈道大會等；每年舉辦「全港分區聯合聖誕報佳音」、「分區佈道事工」及「學生福音事工」等大型事工。同時每年印贈新春佈道單張，免費供全港教會使用。
「全港分區聯合聖誕報佳音」，向全港市民宣告「耶穌已降生」的大喜訊息。
「分區佈道事工」鼓勵地區堂會聯合籌組同區、跨宗派的堂會，按地區特色及居民需要，策畫多元化社區佈道聚會，促進地區堂會合一見證。
「學生福音事工」鼓勵聯會會員堂組織地區堂會與區內學校合作，共同推動及開展青少年（全職學生）福音事工，藉此實踐福音廣傳使命。
此外，傳道部屬下設有「同工組」、「婦女組」及「會員堂退休教牧團契」，每年策動有關教牧同工和教會婦女的聚會，包括講壇事奉研習、專題講座、福音聚會、退修會、聯誼旅遊等。亦透過會員堂退休教牧團契的聚會，關注會員堂退休教牧同工及其配偶身心靈，促進主內聯繫、關愛及靈命造就。團契亦組織「會員堂退休教牧團契詩班」，按節期及邀約作出服侍，謳歌頌揚稱謝主。
教育部近年就教牧長執支援、信徒培育、神學教育、聖樂促進等四大範疇策動事工：
「教牧及長執支援組」藉專業培訓講座及牧養研討會等形式聚會，讓教牧長執在時代巨輪下探討牧養新策略。
「信徒培育組」為信徒舉辦之基督教通識教育活動，擴闊信仰的視野；同時延續聯會過往關注本港性文化及同性婚姻有關議題，透過舉辦講座、研討會、製作微電影等，幫助青少年在多元性文化下持守真理，抵禦情慾橫流的世代。
「神學教育組」跟進本地神學教育事工，設立「香港華人基督教聯會神學獎學金」鼓勵神學生完成造就，委身堂會牧養或宣教事奉；「支持本地神學教育」專款資助本港神學院校之教育工作。
「聖樂促進組」凝聚聖樂事奉人員及教牧同工交流聖樂牧養經驗，舉辦講座、工作坊、研討會及崇拜體驗等，促進教會提升聖樂質素，在崇拜中獻上最美的祭。聯會自二零一八年成立「聯會詩班」，交由教育部主理，現時五十多位詩班員來自不同會員堂，曾於聯會不同聚會及應邀參與其他聯合組織聚會中獻唱事奉，藉同頌聖詩及聖樂作品促進會員堂信徒之間的聯繫。
慈惠部主要負責管理廣蔭頤養院及推動長者事工。
廣蔭頤養院全院名額226個，並設有「暫託住宿服務」及「日間暫託服務」，提供整合醫療及靈性關顧的全面照顧服務。
「長者事工」為表揚年長信徒自愛、愛人及愛主的美德，至今已舉辦了四屆「基督教十大傑出長者選舉」。自二零零九年起每年新春期間舉辦「敬老午餐會」，鼓勵信徒積極帶領未信主親友參與，得蒙主恩真福氣。
「敬老獻金」每年七月及十一月份為「敬老雙月（七、十一）」推動堂會設立「敬老主日」，強調基督信仰「尊敬老人」的教導和實踐；並籲請等主內兄姊踴躍捐助「敬老獻金」。
墓園部管理及發展香港和九龍兩基督教墳場，負責離世信徒安葬事宜。分別位於港島薄扶林的「華人基督教墳場（香港）」及九龍聯合道的「華人基督教墳場（九龍）」。
兩墳場近年進行多項大型工程，改善環境及增建骨庫等。
